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Coriell NA12878标准品:基因组学研究的金标准参考物质
2026-06-26 | 访问量:60

在基因组学研究领域,标准品的选用直接影响测序结果评估的可靠性与可重复性。NA12878标准品作为国际上广泛认可的人类基因组参考物质,在下一代测序(NGS)性能验证、生物信息学流程评估以及临床基因组检测质控中发挥着不可替代的作用。

一、NA12878标准品介绍

NA12878源自CEPH/Utah Pedigree 1463家系,供体为一名北欧和西欧裔白人女性,其外周静脉血经Epstein-Barr病毒(EBV)转化后建立了B淋巴细胞系(LCL),DNA从该淋巴母细胞系中提取而得。该标准品由Coriell医学研究所旗下NIGMS人类遗传细胞储存库管理,每份供应量为25μg。

NA12878之所以成为基因组学领域的标杆,核心在于其被美国国家标准与技术研究院(NIST)选为Genome in a Bottle(GIAB) consortium的首个参考基因组,对应NIST参考物质编号RM8398。经过多个平台、多种算法的深度测序与整合分析,NA12878拥有业界最为完善的高置信度变异集合(high-confidence variant call set),覆盖SNP、InDel及结构变异等多种变异类型,为测序准确度评估提供了权威基准。

值得注意的是,NA12878供体携带CYP2C19*2等位基因——在外显子5的681位核苷酸处发生G-to-A转换,产生异常剪接位点,这个异常剪接会导致40个碱基对的缺失,进而使氨基酸215-227缺失,最终形成一个功能丧失的截短蛋白。这一药物基因组学特征使该标准品在药物代谢酶多态性研究中也具有独特价值。

二、NA12878标准品是DNA还是细胞系

许多研究者关注NA12878标准品是DNA还是细胞系这一问题。事实上,Coriell针对同一供体同时提供两种形式的参考物质:一种是从LCL中提取的基因组DNA产品(编号NA12878 DNA from LCL),另一种是活细胞系产品(编号GM12878)。DNA产品可直接用于测序、PCR等分子生物学实验;细胞系则可在体外持续培养,供研究者自主提取DNA或开展功能学研究。两种形式互为补充,研究者可根据实验需求灵活选择。NIST参考物质RM8398即为从大规模均质化培养的GM12878细胞系中提取的DNA制备而成。

三、NA12878标准品价格

关于NA12878标准品价格,受产品形式(DNA或细胞系)、订购数量、国际物流及关税等因素影响,具体费用需根据实际需求向供应商咨询确认。由于NA12878为Coriell原装进口产品,采购周期通常较长,建议研究机构提前规划并选择可靠的国内代理渠道以保障供应。北京百奥创新作为Coriell产品的专业供应商,可提供Coriell NA12878标准品等DNA标准品,同时配套完善的售前咨询与售后技术支持,帮助科研工作者高效获取所需的参考物质。

无论是全基因组测序验证、变异检出算法基准测试,还是临床检测体系性能评估,NA12878标准品都是不可或缺的质控工具。有需求的科研人员欢迎联系北京百奥创新咨询详情。


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