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Coriell NA12878标准品用途与作用详解及使用说明
2026-07-03 | 访问量:10

在基因组学研究中,参考标准品是保障检测体系准确性与可重复性的关键质控工具。NA12878作为Coriell医学研究所旗下NIGMS人类遗传细胞储存库的标志性产品,凭借其完整的高置信度变异注释数据,已成为下一代测序(NGS)领域应用最为广泛的参考物质之一。本文将围绕NA12878标准品用途、NA12878标准品作用及NA12878标准品说明书相关内容进行系统阐述。

一、NA12878标准品用途

NA12878标准品用途涵盖基因组学研究和临床检测的多个核心环节。首先,在NGS平台性能验证中,NA12878被广泛用于评估全基因组测序(WGS)、全外显子组测序(WES)及靶向面板测序的灵敏度和特异性。研究者通过比对自身测序结果与NIST Genome in a Bottle(GIAB)发布的高置信度变异集合,可定量评估变异检出算法的准确度,识别假阳性和假阴性位点。

其次,NA12878标准品用途还体现在生物信息学流程的基准测试中。不同比对工具、变异检出软件及过滤策略的性能差异,均可借助NA12878的已知真值集进行标准化比较,从而为流程优化提供客观依据。

此外,在临床基因检测实验室的室间质量评价(EQA)和能力验证(PT)中,NA12878也作为共用参考样本,确保不同实验室间检测结果的可比性与互认性。同时,该标准品携带CYP2C19*2药物基因组学变异,在药物代谢酶多态性检测方法的开发与验证中同样具有应用价值。

二、NA12878标准品作用

NA12878标准品作用的核心在于为基因组变异检测提供权威的"真值"参照。该标准品源自CEPH/Utah Pedigree 1463家系中一名白人女性的外周血B淋巴细胞系,经Epstein-Barr病毒转化后建立淋巴母细胞系(LCL),DNA从中提取制备。NIST将其选为GIAB的首个参考基因组,编号RM8398,经多平台、多算法深度测序整合后形成了覆盖SNP、InDel及结构变异的高置信度变异集合。

NA12878标准品作用具体体现在三个层面:一是校准作用——通过已知的基因型基准,校验测序平台的系统误差和批次效应;二是验证作用——确认新建或优化后的检测流程是否达到预期性能指标;三是标准化作用——在多中心合作研究中统一参考尺度,消除因平台或流程差异导致的结果偏差。这三个层面共同构成了基因组检测质量控制的技术基础。

三、NA12878标准品说明书要点

根据NA12878标准品说明书,该产品关键参数如下:供体为CEPH家系成员,性别女性,种族为北欧及西欧裔白人;DNA由LCL提取,每份供应量25 μg,储存于NIGMS人类遗传细胞库;物种来源经核苷磷酸化酶、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶及乳酸脱氢酶同工酶电泳确认为人源。核型为46,XX,9p13.1区域存在拷贝数变异。供体携带CYP2C19*2等位基因,外显子5第681位核苷酸G-to-A转换导致异常剪接。

使用NA12878标准品时,建议遵循以下规范:DNA样本接收后应储存于-20°C避免反复冻融;实验前以荧光法定量确认浓度;测序后使用GIAB官方发布的高置信度区域(v4.2及以上版本)作为基准进行性能评估。

北京百奥创新可提供Coriell NA12878标准品等DNA标准品,并提供详细的产品技术资料与使用指导,有需求欢迎联系咨询。


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